Hodgins n'est toujours pas remis de la prise d'otages dont il a été victime avec Brennan, quand la voiture dans laquelle ils se trouvaient ensemble a été enterrée. Il est peut-être même en partie responsable du kidnapping de Booth par le Grave Digger. En réalité, celui-ci a été immobilisé par une décharge électrique et embarqué dans un jouet de sous-marin jaune. L'équipe tente de retrouver Booth et de découvrir qui l'a kidnappé. Nous apprenons pourquoi le fils de Booth s'appelle Parker.
